24 Şubat 1990 tarihinde İstanbul’da doğan Emir Gökçe, futbola Yıldızspor’da başladı. 2004’te Beşiktaş takımına girdi. 2005-2006 sezonunda B Gençler İstanbul şampiyonu kadroda yer aldı. 2006’da bir maçta Beşiktaş A2’de forma giydi ama 2007-2008 sezonuna dek U-16’da oynamaya devam etti. 2007-2008 sezonunda U-16 liginde gösterdiği performans ile Beşiktaş A2’de oynamaya başladı.
2 Mayıs 2008 tarihinde A takım kadrosundaki sakat ve cezalı oyuncuların olmasından dolayı Ertuğrul Sağlam tarafından kadroya alındı. 4 Mayıs 2008’de ilk maçına Ankaragücü deplasmanında çıktı ve 80. dakikada Mert Nobre’nin yerine girdi. 10 Mayıs 2008’de ise İnönü Stadı’ndaki ilk maçına Vestel Manisaspor karşısına çıktı. 17 Ağustos 2008’de Oktay Derelioğlu’nun jubile maçında forma giyen gençlerden biri oldu. Sonraki sezon da Beşiktaş A2’de oynadı ama sakatlıklarından ötürü kariyeri sekteye uğradı.
2009-2010 sezonu başında Bandırmaspor’a kiralandı ama annesinin geçirdiği rahatsızlık sonucu İstanbul’dan ayrılmama kararı alınca bu transfer gerçekleşmedi. Daha sonra ise 3. Lig takımı İstanbul Kartal Belediyespor’a kiralandı. 20 maçta 2 gol attı. 2010-2011 sezonu başında ön çapraz bağlarının kopması nedeniyle ameliyat oldu. Bu sakatlık nedeniyle o sezonu futbol oynamadan geçirdi ve 2011-2012 sezonunun başında Beşiktaş ile sözleşmesi karşılıklı feshedildi.
2011-2012 sezonunun başında Maltepespor ile sözleşme imzaladı. Ancak bu takımın formasını sadece 2 maçta giyen futbolcu, birkaç ay sonra takımla yollarını ayırdı. Aynı sezonun ara transfer döneminde Küçükçekmecespor ile anlaşdı. Burada yarım sezonda 6 gol atarak iyi bir performans gösterdi. Sonraki sezon 3. Lig ekibi 72 Batmanspor’a transfer oldu. Burada play-off’lara kalma başarısı yaşadı ancak 2. Lig’e yükselemediler. 2013-2014 sezonunda da aynı ligdeki Çorum Belediyespor’a geçti.
2014-2015 sezonunda Karagümrük ile anlaştı, aynı sezonun ikinci yarısını Kartalspor’da geçirdikten sonra, 2015-2016 sezonunda Büyükçekmece Tepecikspor forması giydi.
2016-2017 sezonunda Fethiyespor’da oynadı. 2017-2018 sezonuna Silivrispor ile başladı, ara transfer sezonunda ise Karagümrük ile anlaştı. 2018-2019 sezonuna Karagümrük işe başladı, ara transfer döneminde Elazığspor geçişi yaşadı. 2019-2020 sezonunda Bayrampaşa’ya transfer oldu, yine bir kış transferinde takım değiştirdi bu seferki durağı İstanbulspor’umuz oldu. Bir buçuk sezon yer aldığı ekibimizde 10 maç oynadı. Ekibimizden ayrıldıktan sonra bir takımla anlaşamadı, halen kulüpsüz.
2005 ve 2006’da 4 kez Türkiye U-16 forması giyen Emir Gökçe’ye sağlıklı ve mutlu bir yaşam dileriz.